ได้รับอนุญาตให้จดทะเบียนจัดตั้งเป็นสมาคมพฤกษศาสตร์ จากคณะกรรมการวัฒนธรรมแห่งชาติ โดยมีสำนักงานใหญ่ที่สวนพฤกษศาสตร์สมเด็จพระนางเจ้าสิริกิติ์ องค์การสวนพฤกษศาสตร์ อำเภอแม่ริม จังหวัดเชียงใหม่ เมื่อวันที่ 28 มิถุนายน 2550 และต่อมาได้ทรงพระกรุณาโปรดเกล้าพระราชทานพระมหากรุณาให้สมาคมพฤกษศาสตร์อยู่ในพระบรมราชินูปถัมภ์
วัตถุประสงค์ของสมาคมฯ เพื่อ
1. สนับสนุนส่งเสริมการศึกษาการวิจัยและเผยแพร่งานวิชาการ และวิชาชีพ
ด้านพฤกษศาสตร์
2. ร่วมมือกับองค์กรและหน่วยงานทางด้านพฤกษศาสตร์ และองค์กรอื่นๆ
ที่เกี่ยวข้องทั้งในและต่างประเทศ
3. ร่วมมือกับองค์กรการกุศลอื่นๆ เพื่อสาธารณประโยชน์
4. ไม่ดำเนินงาน เกี่ยวข้องกับการเมืองแต่ประการใด